Bioinformatiker i single-cell immunitets-transkriptomik och epigenomik

1 month ago


Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time
Din roll

Vi söker en erfaren bioinformatiker som vill vara en del av vår forskargrupp och bidra till vår forskning om single-cell immunitets-transkriptomik och epigenomik. Du kommer att arbeta i nära samarbete med våra forskare och andra bioinformatiker för att analysera och visualisera stora mängder data från single-cell RNA-sekvensering och ATAC-seq.

Vårt team

Vår forskargrupp består av erfarna forskare och bioinformatiker som arbetar tillsammans för att förstå mänsklig immunitet och epigenomik. Vi har ett starkt fokus på translationell forskning och samarbetar med kliniska kollegor och laboratoriefaciliteter för att upptäcka nya sjukdomsmekanismer och terapimål.

Vad du kommer att göra
  • Analysera och visualisera stora mängder data från single-cell RNA-sekvensering och ATAC-seq.
  • Arbeta i nära samarbete med våra forskare och andra bioinformatiker för att utveckla nya analyser och visualiseringar.
  • Delta i forskningsprojekt och bidra till vår forskning om single-cell immunitets-transkriptomik och epigenomik.
Vad vi erbjuder

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Vi erbjuder också möjlighet till utveckling och karriärutveckling, samt en flexibel arbetsmiljö med möjlighet att arbeta på distans.

Vi söker en erfaren bioinformatiker som har en doktorsexamen inom bioinformatik eller ett relaterat område. Du bör ha goda kunskaper i R och Python, samt erfarenhet av Unix/Linux och statistikkunskaper. Erfarenhet av genomisk NGS-data och särskilt erfarenhet av att arbeta med scRNA-seq/scATAC-seq från FASTQ till analyserad data är också ett plus.



  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Forskning och utvecklingVi söker en bioinformatiker som vill vara en del av vår forskargrupp och bidra till vår forskning om single-cell immunitets-transkriptomik och epigenomik. Vår forskargrupp studerar utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda lymfoida celler (ILCs), inklusive naturliga mördarceller, och hur dessa celler bidrar till...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Forskning och utvecklingVår forskargrupp studerar utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda lymfoida celler (ILCs), inklusive naturliga mördarceller, och hur dessa celler bidrar till patologi och normal homeostas i organ som lever och livmoder.Vår forskning är translationell eftersom den involverar avancerade grundläggande molekylära...


  • Huddinge, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Niklas Björkström’s forskargrupp studerar utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda lymfoida celler (ILCs), inklusive naturliga mördarceller, och hur dessa celler bidrar till patologi och normal homeostas i organ som lever och livmoder. Studierna är translationella eftersom de involverar avancerade grundläggande...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVår forskargrupp studerar utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda lymfoida celler (ILCs), inklusive naturliga mördarceller, och hur dessa celler bidrar till patologi och normal homeostas i organ som lever och livmoder. Vi söker en bioinformatiker som kommer att arbeta som en integrerad del av vårt team och vara involverad i...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi söker en forskare som ska arbeta med bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata från humana fettvävsbiopsier. Du kommer att arbeta nära forskare med olika bakgrunder och ska kunna prioritera bland dina uppgifter, nå deadlines och arbeta självständigt. Vem är du? För att kvalificera dig bör du ha en...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en driven och motiverad forskare för att arbeta med bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata från humana fettvävsbiopsier. Du kommer att arbeta nära forskare med olika bakgrunder och vara en viktig del av vårt team.Vem är du?För att kvalificera dig bör du ha en masterexamen eller motsvarande i ett...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll är att arbeta med bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata från humana fettvävsbiopsier. Du kommer att arbeta nära forskare med olika bakgrunder och vara delaktig i projektet från början till slut. Vem är du? För att kvalificera dig bör du ha en masterexamen eller motsvarande i ett relevant område. Du...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll är att utföra bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata främst baserade på humana fettvävsbiopsier. Dessa data kommer att valideras i cellmodeller med exempelvis CRISPR/Cas9-medierad editering i mesenkymala stamceller. Detta är en temporär position på sex månader som kan förlängas beroende på projektets...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Centrerad kring bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata baserade på humana fettvävsbiopsier från friska försökspersoner och patienter med olika kardiometabola sjukdomar. Nyckelfynd kommer valideras i cellmodeller med exempelvis Cas9-medierad editering i mesenkymala stamceller. Vem är du? För att kvalificera...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll fokuserar på bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata från humana fettvävsbiopsier. Dessa biopsier kommer från både friska individer och patienter med olika kardiometabola tillstånd. Viktiga resultat kommer att valideras i cellmodeller, exempelvis genom Cas9-medierad genredigering i mesenkymala stamceller....


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll kommer att fokusera på bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata som härrör från humana fettvävsbiopsier. Dessa biopsier kommer att tas från både friska individer och patienter med olika kardiometabola tillstånd. Viktiga resultat kommer att valideras i cellmodeller, inklusive exempelvis Cas9-medierad...


  • Huddinge, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll är centrerad kring bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata baserade på humana fettvävsbiopsier från friska försökspersoner och patienter med olika kardiometabola sjukdomar. Nyckelfynd kommer valideras i cellmodeller med exempelvis Cas9-medierad editering i mesenkymala stamceller. Positionen är på sex...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollDen tillgängliga postdoktorala tjänsten syftar till att utveckla och implementera innovativa genomiska tekniker för att analysera eukaryotiskt genuttryck i en oöverträffad omfattning genom att kombinera experimentella metoder med datadrivna strategier.Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen initierat ERC-synergiprojekt i...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Den lediga postdoktorala tjänsten syftar till att utveckla och implementera innovativa genomiska tekniker för att analysera eukaryotiskt genuttryck i en oöverträffad omfattning genom att förena experimentella metoder med beräkningsanalys. Den utvalda kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen beviljat ERC-synergiprojekt i...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en postdoktor som vill bidra till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala. Du kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en skicklig bioinformatiker för att arbeta med ett europeiskt projekt som syftar till att identifiera molekylära profiler för respons och utebliven respons på olika behandlingar för immunmedierade sjukdomar.Vem är du?För att vara kvalificerad för denna tjänst krävs en doktorsexamen inom ett relevant område. Meriterande är...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en erfaren bioinformatiker som kan bidra till vår forskning inom beräkningsbiologi. Rollen innefattar att skapa och underhålla Julia-kodbaser och paket, samt att genomföra beräkningsexperiment och jämföra olika metoder.Vem är du?Krav för tjänsten:Påvisbar expertis inom programmering och metodutveckling inom...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en erfaren bioinformatiker som kan bidra till vår forskning inom beräkningsbiologi. Rollen innefattar att skapa och underhålla Julia-kodbaser och paket, samt att genomföra beräkningsexperiment och jämföra olika metoder.Krav för tjänstenExpertis inom programmering och metodutveckling inom beräkningsbiologi, med fokus på...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en erfaren bioinformatiker som kan bidra till vår forskning inom beräkningsbiologi. Rollen innefattar att utveckla och underhålla Julia-kodbaser och paket, samt att genomföra beräkningsexperiment och jämföra olika metoder.Krav för tjänstenExpertis inom programmering och metodutveckling inom beräkningsbiologi, med fokus på...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollMjösbergsgruppen studerar utvecklingen, regleringen och funktionen av medfödda lymfoida celler (ILC), i människor, och hur dessa celler bidrar till patologi i slemhinnor som lunga och tarm. Studierna är translationella eftersom de involverar avancerade molekylära och cellulära immunologiska undersökningar av mänskliga vävnadsprover för att...