Postdoktor inom eukaryot-RNA-genomik

3 weeks ago


Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

Din roll

Vi söker en postdoktor som vill bidra till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala. Du kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin Verstrepen (Leuven) och prof. Julien Gagneur (München).

Projektbeskrivning

EPIC kommer att kombinera användningen av genomisk, syntetisk biologi, maskininlärning och evolutionära tillvägagångssätt med målet att förstå den fullständiga regleringskoden för genuttryck för S. cerevisiae och andra eukaryoter. Du kommer att fokusera på kartläggning och förutsägelse av mRNA-gränser i en aldrig tidigare skådad skala. Du kommer också att använda den genererade informationen för att kvantifiera och förutsäga hur mRNA-variationer leder till divergerande mRNA-öden.

Arbetsuppgifter

Arbetet kommer att innefatta integrering av olika experimentella- och beräkningsbaserade metoder för att slutföra projektet, inklusive genomik, jästgenetik, högkapacitetsbiologiska tillvägagångssätt och bioinformatik. Du kommer att utföra originell forskning inom transkriptomik och beräkningsbiologi, och skaffa de nödvändiga experimentella och beräkningsfärdigheter som krävs för att slutföra projektet.

Krav

  • Doktorstitel inom molekylärbiologi, bioteknik, genetik eller liknande område.
  • Erfarenhet av att tolka biologiska data och experimentellt testa sin hypotes med ett stort intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling.
  • Lång erfarenhet av molekylärbiologiska metoder såsom RNA-Seq, ATAC-Seq, molekylär kloning och RNA-biologi.
  • Forskningserfarenhet av storskaliga analyser och bioinformatik (NGS, batch- och/eller R/Python-skriptspråk).
  • God samarbetsförmåga och förmåga att arbeta i team.

Meriterande

  • Tidigare erfarenhet av jästgenetik, transkription/post-transkriptionell mRNA-reglering, högkapacitetsrobotik och syntetisk biologi.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.



  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Om tjänstenVi söker en postdoktor med expertis inom eukaryot RNA-genomik för att delta i ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt vid Karolinska Institutet.FörutsättningarAvlagd doktorsexamen i molekylärbiologi, bioteknik, genetik eller liknande område.Erfarenhet av att tolka biologiska data och experimentellt testa sin hypotes med ett stort intresse...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en postdoktor med starka kunskaper inom RNA-genomik för att arbeta med ett ERC-synergiprojekt inom ramen för Karolinska Institutet. Projektet syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck på en aldrig tidigare skådad skala.Vad erbjuder vi?En kreativ, internationell miljö med...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en postdoktor för att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala. Du kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin Verstrepen...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en postdoktor för att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala. Du kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin Verstrepen...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Den tillgängliga postdoktorala positionen syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala genom att kombinera experimentellt arbetssätt med beräkningsmetoder. Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC -...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollDen lediga postdoktorala tjänsten syftar till att utveckla och implementera innovativa genomiska tekniker för att undersöka eukaryotiskt genuttryck på en oöverträffad skala genom att förena experimentella metoder med datadrivna strategier.Kandidaten kommer att ingå i ett nyligen initierat ERC-synergiprojekt i samarbete med framstående...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en erfaren postdoktor inom RNA-biologi och genomik för att arbeta i vår forskargrupp. Som postdoktor kommer du att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptomomfattande tillvägagångssätt för att studera genuttryck och transkriptreglering med hjälp av data från patienter och cellmodeller.Vad erbjuder vi?En kreativ och...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll I din roll som Postdoktor kommer du att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptomomfattande tillvägagångssätt (baserade på bulk- och encells-RNA-sekvensering) för att studera genuttryck och transkriptreglering med hjälp av data erhållna från patienter och cellmodeller. Detta projekt fokuserar på rollerna för regulatoriska...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Den lediga postdoktorala tjänsten syftar till att utveckla och implementera innovativa genomiska tekniker för att analysera eukaryotiskt genuttryck i en oöverträffad omfattning genom att förena experimentella metoder med beräkningsanalys. Den utvalda kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen beviljat ERC-synergiprojekt i...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollDen tillgängliga postdoktorala tjänsten syftar till att utveckla och implementera innovativa genomiska tekniker för att analysera eukaryotiskt genuttryck i en oöverträffad omfattning genom att kombinera experimentella metoder med datadrivna strategier.Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen initierat ERC-synergiprojekt i...


  • Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    RollbeskrivningI rollen som postdoktor kommer du att tillämpa och integrera nya transkriptomomfattande tillvägagångssätt för att studera genuttryck och transkriptreglering. Detta projekt fokuserar på rollerna för regulatoriska RNA i genomets organisation.Vad vi sökerVi söker dig med erfarenhet inom genomik, beräkningsbiologi och/eller statistik...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollKarolinska Institutet söker en postdoktor med erfarenhet av single-cell RNA-sekvensering och flödescytometri för att arbeta inom Mjösbergsgruppen.Gruppen studerar utvecklingen, regleringen och funktionen av medfödda lymfoida celler (ILC) i människor och hur dessa celler bidrar till patologi i slemhinnor som lunga och tarm.Projektet har redan...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Om rollenVi söker en postdoktor som vill vara en del av vår forskargrupp inom tumörimmunologi vid Karolinska Institutet. Som postdoktor kommer du att arbeta med att analysera data från single-cell RNA-sekvensering (scRNA-seq) för att förstå den human tarmslemhinnans lymfocytbiologi i hälsa och sjukdom.FörutsättningarAvlagd doktorsexamen inom...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en postdoktor med stark självständig arbetsförmåga för att studera de transkriptomiska profilerna av genetiskt spårade intervertebrala diskceller och fettvävnadsceller. Arbetet kommer att inkludera analys av singelcell/kärnadata, konfokal avbildning, immunfluorescens och standardtekniker för molekylärbiologi.Vem är du?Vi söker...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Denna tjänst är en del av en strategisk satsning för att stärka forskningen inom RNA-biologi vid MedH. Innehavaren av professuren förväntas bedriva forskning på högsta internationella nivå inom detta område. I uppdraget ingår att leda och utveckla egen forskning samt att initiera nya kliniska samarbetsprojekt. Den anställde...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en postdoktor som kommer att studera de transkriptomiska profilerna av genetiskt spårade intervertebrala diskceller och fettvävnadsceller. Forskningsarbetet inkluderar analys av singelcell/kärnadata, konfokal avbildning, immunfluorescens och standardtekniker för molekylärbiologi.Vem är du?Vi söker en mycket motiverad postdoktor med...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollDenna tjänst är en del av en strategisk satsning för att stärka forskningen inom RNA-biologi vid MedH. Innehavaren av professuren förväntas bedriva forskning på högsta internationella nivå inom detta område. I uppdraget ingår att leda och utveckla egen forskning samt att initiera nya kliniska samarbetsprojekt. Den anställde förväntas ta...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollDenna tjänst är en del av en strategisk satsning för att stärka forskningen inom RNA-biologi vid MedH. Innehavaren av professuren förväntas bedriva forskning på högsta internationella nivå inom detta område. I rollen ingår att leda och utveckla egen forskning samt att initiera nya kliniska samarbetsprojekt. Den anställde förväntas ta...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollMjösbergsgruppen studerar utvecklingen, regleringen och funktionen av medfödda lymfoida celler (ILC), i människor, och hur dessa celler bidrar till patologi i slemhinnor som lunga och tarm. Studierna är translationella eftersom de involverar avancerade molekylära och cellulära immunologiska undersökningar av mänskliga vävnadsprover för att...


  • Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din rollVi söker en postdoktor som kommer att studera de transkriptomiska profilerna av genetiskt spårade intervertebrala diskceller och fettvävnadsceller. Forskningsarbetet kommer att inkludera analys av singelcell/kärnadata, konfokal avbildning, immunfluorescens och standardtekniker för molekylärbiologi. Du förväntas ha förmågan att...