Bioinformatiker i single-cell immunitets-transkriptomik och epigenomik
4 weeks ago
Forskning och utveckling
Vår forskargrupp studerar utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda lymfoida celler (ILCs), inklusive naturliga mördarceller, och hur dessa celler bidrar till patologi och normal homeostas i organ som lever och livmoder.
Vår forskning är translationell eftersom den involverar avancerade grundläggande molekylära och immunologiska undersökningar av värdefulla mänskliga vävnadsprover för att upptäcka nya sjukdomsmekanismer och terapimål.
Arbetsuppgifter
Bioinformatikern kommer att arbeta i nära samarbete med alla medlemmar i teamet för att fortsätta den framgångsrika forskningslinjen med användning av single-cell RNA-sekvensering (scRNA-seq) och ATAC-seq för att dissekera mänsklig ILC-biologi i hälsa och sjukdom.
Bioinformatikern kommer att vara en del av Center for Infectious Medicine (CIM), Karolinska Institutet, vilket är ett nationellt ledande och internationellt konkurrenskraftigt center för mänsklig translationell immunologi och forskning om infektionssjukdomar.
Krav och fördelar
Vi söker en bioinformatiker som kommer att arbeta som en integrerad del av vårt team och vara involverad i flera pågångna projekt.
Vi erbjuder en kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla.
Krav på kandidaten
Den framgångsrika kandidaten ska ha en doktorsexamen inom bioinformatik/datavetenskap eller ett relaterat område.
Fullt behärska R och Python och ha gedigen erfarenhet av Unix/Linux samt statistikkunskaper.
Ha erfarenhet av genomisk NGS-data och särskilt erfarenhet av att arbeta med scRNA-seq/scATAC-seq från FASTQ till analyserad data.
Goda språkkunskaper i engelska, både i tal och skrift, är ett krav.
-
Huddinge, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin roll Niklas Björkström’s forskargrupp studerar utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda lymfoida celler (ILCs), inklusive naturliga mördarceller, och hur dessa celler bidrar till patologi och normal homeostas i organ som lever och livmoder. Studierna är translationella eftersom de involverar avancerade grundläggande...
-
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollVår forskargrupp studerar utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda lymfoida celler (ILCs), inklusive naturliga mördarceller, och hur dessa celler bidrar till patologi och normal homeostas i organ som lever och livmoder. Vi söker en bioinformatiker som kommer att arbeta som en integrerad del av vårt team och vara involverad i...
-
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeOm ossKarolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla.Vårt arbeteVi söker en biologisk informationsanalysare som kommer att arbeta med oss i vår forskargrupp, studerande utveckling, reglering och funktion av mänskliga medfödda...
-
Forskare i systembiologiska studier av fettväv
1 month ago
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin roll är att arbeta med bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata från humana fettvävsbiopsier. Du kommer att arbeta nära forskare med olika bakgrunder och vara delaktig i projektet från början till slut. Vem är du? För att kvalificera dig bör du ha en masterexamen eller motsvarande i ett relevant område. Du...
-
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin roll är att utföra bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata främst baserade på humana fettvävsbiopsier. Dessa data kommer att valideras i cellmodeller med exempelvis CRISPR/Cas9-medierad editering i mesenkymala stamceller. Detta är en temporär position på sex månader som kan förlängas beroende på projektets...
-
Bioinformatiker: Utveckla Medveten Dataanalys
2 weeks ago
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeOm RollenInom Karolinska Institutets omfattande forskningsmiljö har vi ett unikt tillfälle för en erfaren bioinformatiker att delta i utvecklingen av vår datadriven beräkningsbiologi.Rollens BeskrivningRollen innebär att bidra till, skapa och underhålla Julia-kodbaser och paket samt genomföra komplexa beräkningsexperiment med inriktning på...
-
Huddinge, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin roll är centrerad kring bioinformatiska analyser av proteomik-, transkriptomik- och metabolomikdata baserade på humana fettvävsbiopsier från friska försökspersoner och patienter med olika kardiometabola sjukdomar. Nyckelfynd kommer valideras i cellmodeller med exempelvis Cas9-medierad editering i mesenkymala stamceller. Positionen är på sex...
-
Bioinformatiker för immunmedierade sjukdomar
3 weeks ago
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollVi söker en skicklig bioinformatiker för att arbeta med ett europeiskt projekt som syftar till att identifiera molekylära profiler för respons och utebliven respons på olika behandlingar för immunmedierade sjukdomar.Vem är du?För att vara kvalificerad för denna tjänst krävs en doktorsexamen inom ett relevant område. Meriterande är...
-
Postdoktor inom eukaryot-RNA-genomik
1 month ago
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollVi söker en postdoktor som vill bidra till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala. Du kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin...
-
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollVi söker en erfaren bioinformatiker som kan bidra till vår forskning inom beräkningsbiologi. Rollen innefattar att skapa och underhålla Julia-kodbaser och paket, samt att genomföra beräkningsexperiment och jämföra olika metoder.Vem är du?Krav för tjänsten:Påvisbar expertis inom programmering och metodutveckling inom...
-
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeKarriärmöjlighet på världsledande medicinska universitetVi erbjuder en kreativ och internationell arbetsmiljö med stor nyfikenhet, där du som postdoktor kan arbeta med bioinformatik, maskininlärning av transkriptomdata inom ett europeiskt projekt om immunmedierade sjukdomar. Projektet finansieras av Innovative Medicines Initiative Joint Undertaking...
-
Postdoktor i tumörimmunologi
1 month ago
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollMjösbergsgruppen studerar utvecklingen, regleringen och funktionen av medfödda lymfoida celler (ILC), i människor, och hur dessa celler bidrar till patologi i slemhinnor som lunga och tarm. Studierna är translationella eftersom de involverar avancerade molekylära och cellulära immunologiska undersökningar av mänskliga vävnadsprover för att...
-
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeRollenVi söker en erfaren bioinformatiker som vill bidra till vår expertis inom programmering och metodutveckling inom beräkningsbiologi. Rollen inkluderar att skapa, underhålla och utveckla Julia kodbaser och paket. Du kommer att arbeta med beräkningsexperiment, jämförelser av olika metoder och visualisering av data.KravExpertis inom programmering...
-
Postdoktor inom tumörimmunologi
3 weeks ago
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollKarolinska Institutet söker en postdoktor med erfarenhet av single-cell RNA-sekvensering och flödescytometri för att arbeta inom Mjösbergsgruppen.Gruppen studerar utvecklingen, regleringen och funktionen av medfödda lymfoida celler (ILC) i människor och hur dessa celler bidrar till patologi i slemhinnor som lunga och tarm.Projektet har redan...
-
Postdoktor i tumörimmunologi
6 months ago
Huddinge, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin roll Mjösbergsgruppen studerar utvecklingen, regleringen och funktionen av medfödda lymfoida celler (ILC), i människor, och hur dessa celler bidrar till patologi i slemhinnor som lunga och tarm. Studierna är translationella eftersom de involverar avancerade molekylära och cellulära immunologiska undersökningar av mänskliga vävnadsprover...
-
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Full timeOm tjänstenVår verksamhet på KITM innefattar storskalig analysverksamhet med högteknologisk utrustning inom Klinisk Immunologi och Transfusionsmedicin, inklusive bloddonation och patientverksamhet inom hemoterapi. Tjänsten är placerad på enheten för Klinisk Immunologi i Huddinge som bland annat utför analyser inom transplantationsimmunologi,...
-
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollVår forskningsavdelning söker en erfaren forskningsassistent som kan bidra till vår forskning inom genombiologi och cancergenetik. Som forskningsassistent kommer du att arbeta med att validera nya metoder och ta itu med grundläggande frågor inom området.AnsvarsområdenCellodling och läkemedelsbehandling av olika humana cellinjerGenetisk...
-
Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time{"Din roll">Vi söker en forskningsassistent som kommer att spela en nyckelroll i vår forskningsavdelning med fokus på genomreplikation och cancerbiologi. För att bekämpa sjukdomar som cancer behöver vi öka vår förståelse kring de processer som styr celldelning och DNA-replikation. Vi erbjuder en kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld...
-
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollVi söker en forskningsspecialist till vårt centrum för cervixcancereliminering. Du kommer att arbeta med databashantering och analys av registerdata för att öka kunskapen om SARS-CoV-2 och förhindra cervixcancer. Anställningen är uppdelad i två lika stora delar, där den ena delen innefattar analys av SARS-CoV-2 data och den andra delen...
-
Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full timeDin rollVi söker en driftig forskningsspecialist som vill bidra till att förstå och bekämpa cervixcancer. Du kommer att arbeta med databashantering och analys av registerdata för att öka kunskapen om SARS-CoV-2 och förhindra cervixcancer. Rollen är uppdelad i två delar: en del handlar om att analysera SARS-CoV-2-data och den andra om att analysera...