Doktorand inom multimodal modellering av rumsliga biologiska data

2 weeks ago


Solna, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

Anställningen ingår i SciLifeLab och Wallenberg National Program for Data-Driven Life Science (DDLS) och är en del av dess nationella forskarskola Data-Driven Life Science (DDLS) - SciLifeLab med 20 akademiska och 7 industriella doktorander. Projektbeskrivning Forskarutbildningsämne: Bioteknologi Ämnet berör spatiell biologi, som omfattar ett brett spektrum av teknologier som kvantifierar olika typer av biomolekyler in situ. Tillgänglig teknologi ger information om distinkta aspekter av vävnadsanatomi, såsom dess morfologi, genom, transkriptom, proteom och metabolom. Att heltäckande karakterisera en vävnad kräver att man kombinerar flera tekniker, vilket kan vara kostsamt eller utmanande experimentellt. Studenten kommer att utveckla metoder för multimodal modellering av spatiell biologi data som integrerar olika datatyper och kan användas för cross-modal dataöverföring. Multimodala generativa modeller kommer sannolikt att bli ett allt viktigare biologiskt forskningsverktyg. På grund av den komplexa naturen hos många biologiska system är det osannolikt att någon enskild modalitet beskriver deras egenskaper fullt ut. Därför är det avgörande att utnyttja en kunskapsbas som spänner över flera modaliteter och anatomiska förhållanden för att tolka data och påskynda upptäckten. För detta ändamål kommer doktoranden att använda våra unika rumsliga multimodala data av vävnadsmorfologi, genuttryck, genomintegritet och metaboliter. Det primära målet för doktoranden är att utforska spatiella data och utveckla datadrivna metoder för att förbättra vår förståelse av biologiska system i hälsa och sjukdom. I tjänsten ingår även undervisning och andra arbetsuppgifter på institutionen. Handledning: Prof Joakim Lundeberg, föreslås som huvudhandledare, Prof Jens Lagergren, föreslås som bi-handledare. Beslut tas vid antagning Vi erbjuder Möjligheten att doktorera i en dynamisk, internationell forskarmiljö i samarbete med industrin och framstående universitet världen över. En arbetsplats med många anställningsförmåner och månadslön enligt KTH: s avtal för doktorandlöner. Forskarutbildning vid ett lärosäte som är aktivt och stöttande i frågor som rör t.ex. arbetsvillkor, jämställdhet och mångfald samt studiemiljö. Arbete och studier i Stockholm med närhet till natur och hav. Behörighet för antagning För att bli antagen till forskarutbildning (kap 7 39 § högskoleförordningen) krävs att den sökande har grundläggande behörighet: avlagt en examen på avancerad nivå, eller fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. Det är viktigt att du har gedigna programmeringsfärdigheter för hantering av biologisk dataanalys stor skala. Det är därför viktigt att du: har erfarenhet av maskininlärning i PyTorch eller JAX erfarenhet av användning av objektorienterad programmering inom biologisk dataanalys erfarenhet av användning av versionshanteringssystem som Git, repositories som GitHub/GitLab förståelse för molekylärbiologi, särskilt i sammanhang med mänskliga sjukdomar har dokumenterad erfarenhet av analys av data från sekvenseringsmetoder är bekant med foundational modeller erfarenhet av att utforma, genomföra och analysera experimentell forskning har förmåga att formulera forskningsfrågor och hypoteser Utöver ovanstående finns också ett obligatoriskt krav på engelska motsvarande Engelska B/6. Urval För att lyckas med dina doktorandstudier på KTH behöver du vara målinriktad och ihärdig i ditt arbete. Vid urval av de sökande bedöms förmågan att: självständigt driva sitt arbete framåt, kunna samarbeta med andra, ha ett professionellt förhållningssätt och analysera och arbeta med komplexa frågor arbeta inom tvärvetenskapliga team och med externa samarbetspartners hålla sig uppdaterad om de senaste framstegen inom data-driven metodik. Efter behörighetskraven kommer stor vikt läggas vid personliga egenskaper. Målexamen: Doktorsexamen Information om antagning och anställning Endast den som antagits till forskarutbildning får anställas som doktorand. Den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år. En anställd doktorand kan i begränsad omfattning (högst 20 %) utföra vissa arbetsuppgifter inom t.ex. utbildning och administration. En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år, anställningen får därefter förnyas med högst två år i taget. Vid studier som ska avslutas med licentiatexamen får den sammanlagda anställningstiden inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under två år. Fackliga representanter Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida. Doktorandsektionen (Tekniska högskolans studentkår) Du hittar kontaktuppgifter till doktorandsektionen på sektionens webbsida. Ansökan Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in. Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time). Ansökan ska ha följande innehåll CV med relevanta professionella erfarenheter och kunskaper. Ansökningsbrev med en kortfattad redogörelse om varför du vill bedriva forskarstudier, om dina akademiska intressen och hur de relaterar till dina tidigare studier och framtida mål. (Max 2 sidor) Kopior av examensbevis och betyg från tidigare universitetsstudier och intyg på uppfyllda språkkrav (se ovan). Översättningar till engelska eller svenska om originaldokumentet inte är utfärdade på ett av dessa språk. Kopior av original ska vidimeras Representativa publikationer eller tekniska rapporter. För längre dokument, bifoga gärna en sammanfattning (abstract) och en webblänk till den fullständiga texten Övrigt Strävan efter jämställdhet, mångfald och lika villkor är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering. Anställningen kan komma att omfatta säkerhetskänslig verksamhet. För att bli behörig behöver du därför klara en eventuell säkerhetsprövning. Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.


  • Data Scientist

    4 days ago


    Solna, Sweden Dun & Bradstree Full time

    You will be part of our B2C Sales & Marketing Services Analytics team. We are a team of data scientists and analysts, working across the Nordics to create, promote and grow our B2C offering. Our success relies on collaboration – both within the team, and with other teams such as Product, Data, Tech and Sales teams.  Job description Analyze large...


  • Solna, Sweden Telia Company Full time

    Are you a Data Steward / Information owner who loves driving change? My name is Kajsa and I lead the Process, Information & CRM team in B2B at Telia. We are looking för a Data Steward/Information Owner who can work with creation and implementation of a new information structure within Telia B2B organization during our ongoing transformation. Are you our...


  • Solna, Sweden Telia Company Full time

    Are you a Data Steward / Information owner who loves driving change? My name is Charlotte and I lead the Process, Information & CRM team in B2B at Telia. We are looking för a Data Steward/Information Owner who can work with creation and implementation of a new information structure within Telia B2B organization during our ongoing transformation. Are you...

  • Business Data Analyst

    4 weeks ago


    Solna, Sweden Vattenfall AB Full time

    Vill du arbeta med analys med fokus på affär och marknad? Vattenfall Consumer Sales Nordic söker nu en Business Data Analyst med god analytisk förmåga och ett tydligt affärs- och kundfokus. Som Business Data Analyst arbetar du med att omvandla komplex data till användbara affärsinsikter. Du är ansvarig för att förmedla insikter och...

  • Data Engineer

    4 weeks ago


    Solna, Sweden Deploja AB Full time

    Role: Collaborate with data scientists and machine learning engineers to develop machine learning software products that will be scaled out to an extensive network.Design develop and maintain the largescale data infrastructure required for machine learning projects.Leverage the understanding of software architecture and software design patterns to write...

  • Business Data Analyst

    4 weeks ago


    Solna, Sweden Vattenfall Full time

    About the job Vill du arbeta med analys med fokus på affär och marknad? Vattenfall Consumer Sales Nordic söker nu en Business Data Analyst med god analytisk förmåga och ett tydligt affärs- och kundfokus. Som Business Data Analyst arbetar du med att omvandla komplex data till användbara affärsinsikter. Du är ansvarig för att förmedla...

  • Data Engineer

    20 hours ago


    Solna, Sweden Telia Company Full time

    Data, Data Visualization and AI/ML are keys for the future success of Telia Company and thus Telia Broadband Data Mediation Team is looking for a Data Engineer for the Broadband Big Data solution area to strengthen and enhance our mobile core, IP network, coding and ML skillset.  Ready to make better happen? Broadband Data Mediation Team is part of...

  • Data Engineer

    2 weeks ago


    Solna, Sweden Deploja AB Full time

    Role: Expertise in GCP particularly datarelated services such as BigQuery Dataflow and Dataproc Proficiency in SQL Indepth knowledge of one or more programming languages preferably Python Expertise in database design and data modeling Expertise in DevOps Terraform CI/CD Experience with the Agile Way of Working Big bonus if familiar with Kafka Azure...


  • Solna, Sweden Sbab Full time

    Hallå!Enhetschef inom Data ScienceBrinner för att leverera affärsvärde, att transformera data till värde Leda och rekrytera ett eller flera team av dataanalytiker, data scientists och utvecklare Ansvarar, tillsammans med andra enhetschefer på DS, att förankra samt exekvera på vår datastrateg SBAB Stockholm


  • Solna, Sweden SBAB Full time

    Arbetsuppgifter Brinner för att leverera affärsvärde, att transformera data till värde Leda och rekrytera ett eller flera team av dataanalytiker, data scientists och utvecklare Ansvarar, tillsammans med andra enhetschefer på DS, att förankra samt exekvera på vår datastrateg Saknar du fart, fläkt och förändring på jobbet? Bra! Det behöver...

  • Data Engineer

    3 weeks ago


    Solna, Sweden Deploja AB Full time

    Role: Creating maintaining and enhancing data pipelines for extracting data via REST based APIs to enable near real time reporting for Warehouse Operations on Azure Creating maintaining and enhancing reports and datasets on PowerBI to enable historical and real time reporting Maintaining and enhancing an existing Product (SKU) classification solution...


  • Solna, Sweden Polarium Full time

    Since our inception in 2015, Polarium has been at the forefront of transforming the energy industry. Our commitment to innovation has led us to unlock the vast potential of energy storage systems, providing a range of intelligent and digital services. We take pride in our ability to meet challenges head-on, which fuels our creation of next-generation...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi söker nu en forskningsspecialist för att stärka institutionens forskning om sociala medier och psykisk hälsa bland unga. Du kommer att arbeta inom ramen för ett projekt finansierat av FORTE. Arbetet innebär dataanalys, att skriva vetenskapliga artiklar utifrån projektets forskningsplan, projektledning och handledning av en doktorand....

  • Data Engineer

    3 weeks ago


    Solna kommun, Sweden Telia Company Full time

    Data, Data Visualization and AI/ML are keys for the future success of Telia Company and thus Telia Broadband Data Mediation Team is looking for a Data Engineer for the Broadband Big Data solution area to strengthen and enhance our mobile core, IP network, coding and ML skillset. Ready to make better happen? Broadband Data Mediation Team is part of Telia...

  • Business Data Analyst

    4 weeks ago


    Solna Municipality, Sweden Vattenfall Full time

    JobbeskrivningVill du arbeta med analys med fokus pÃ¥ affär och marknad?Vattenfall Consumer Sales Nordic söker nu en Business Data Analyst med god analytisk förmÃ¥ga och ett tydligt affärs- och kundfokus.Som Business Data Analyst arbetar du med att omvandla komplex data till användbara affärsinsikter. Du är ansvarig för att förmedla insikter och...


  • Solna kommun, Sweden Polarium Full time

    Since our inception in 2015, Polarium has been at the forefront of transforming the energy industry. Our commitment to innovation has led us to unlock the vast potential of energy storage systems, providing a range of intelligent and digital services. We take pride in our ability to meet challenges head-on, which fuels our creation of next-generation...


  • Sundbyberg, Solna kommun, Sweden Swedbank AB (publ) Full time

    Är du nyfiken på att bygga hållbara data-plattformar med hög tillförlitlighet och kvalitet? Nu söker Swedbank en Data Quality Specialist till det nya teamet för hantering av Group Risk Data inom Group Risk. Det nya teamet, Group Risk Data Management, skall bygga en helt dy dataplattform för modellering, analys och rapportering av Swedbankkoncernens...

  • Student worker

    3 weeks ago


    Solna, Sweden Siemens AB Full time

    Student worker – Digital Business and Data Analytics Are you passionate about solving some of the world's most pressingchallenges? Are you interested in developing your career path within a globaltechnology powerhouse which empowers employee creativity to change, challenge,and influence our business and customer relationships? Excited to welcome a...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Den tillgängliga postdoktorala positionen syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala genom att kombinera experimentellt arbetssätt med beräkningsmetoder. Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC -...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll I din roll som Postdoktor kommer du att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptomomfattande tillvägagångssätt (baserade på bulk- och encells-RNA-sekvensering) för att studera genuttryck och transkriptreglering med hjälp av data erhållna från patienter och cellmodeller. Detta projekt fokuserar på rollerna för regulatoriska...