Postdoktor inom eukaryot-RNA-genomik

4 weeks ago


Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

Din roll

Den tillgängliga postdoktorala positionen syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala genom att kombinera experimentellt arbetssätt med beräkningsmetoder.

Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin Verstrepen (Leuven) och prof. Julien Gagneur (München). EPIC kommer att kombinera användningen av genomisk, syntetisk biologi, maskininlärning och evolutionära tillvägagångssätt med målet att förstå den fullständiga regleringskoden för genuttryck för S. cerevisiae och andra eukaryoter.

Den rekryterade kandidaten kommer att fokusera på kartläggning och förutsägelse av mRNA-gränser i en aldrig tidigare skådad skala. Kandidaten kommer också att använda den genererade informationen för att kvantifiera och förutsäga hur mRNA-variationer leder till divergerande mRNA-öden. Kandidaten kommer att integrera olika experimentella- och beräkningsbaserade metoder för att slutföra projektet, inklusive genomik, jästgenetik, högkapacitetsbiologiska tillvägagångssätt och bioinformatik. Kandidaten kommer att utföra orginell forskning inom transkriptomik och beräkningsbiologi, och skaffa de nödvändiga experimentella och beräkningsfärdigheter som krävs för att slutföra projektet.

Kandidaten förväntas kommunicera de vetenskapliga resultaten genom att upprätta vetenskapliga artiklar och delta i vetenskapliga möten. Den idealiska kandidaten kommer att delta i teamets allmänna uppgifter och effektivt kommunicera med forskare med olika bakgrund i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö.

Arbetsspråket är engelska.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Utöver ovan nämnda krav för tjänsten:

Sökande till denna tjänst bör ha en doktorsexamen i molekylärbiologi, bioteknik, genetik eller liknande område. Den framgångsrike sökande bör ha erfarenhet av att tolka biologiska data och experimentellt testa sin hypotes med ett stort intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling.  Den lämplige kandidaten bör ha lång erfarenhet av molekylärbiologiska metoder såsom RNA-Seq, ATAC-Seq, molekylär kloning och RNA-biologi. Forskningserfarenhet av storskaliga analyser och bioinformatik (NGS, batch- och/eller R/Python-skriptspråk) är också nödvändigt. Ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling, nytänkande och kreativt tänkande är väsentligt. God samarbetsförmåga och förmåga att arbeta i team är en förutsättning.

Meriterande för tjänsten: 

Tidigare erfarenhet av jästgenetik, transkription/post-transkriptionell mRNA-reglering, högkapacitetsrobotik och syntetisk biologi är meriterande.

Vid anställningen kommer särskild vikt att läggas vid vetenskaplig skicklighet av relevans för projektet och vid tidigare forskningserfarenhet. 

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.



  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll I din roll som Postdoktor kommer du att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptomomfattande tillvägagångssätt (baserade på bulk- och encells-RNA-sekvensering) för att studera genuttryck och transkriptreglering med hjälp av data erhållna från patienter och cellmodeller. Detta projekt fokuserar på rollerna för regulatoriska...


  • Solna, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    Arbetsuppgifter Professor Tuuli Lappalainens forskargrupp söker en postdoktor till ett ERC-finansierat forskningsprojekt som kopplar variation i gendosering till cellulära egenskaper med hjälp av ett systemgenetisk synsätt. Projektet kombinerar experimentellt arbete med CRISPR och encellsmetoder med beräkningsanalys. Det specifika projektet kommer att...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Anställningen gäller en tjänst vid Genomics Production som är en del av National Genomics Infrastructure - Stockholm, lokaliserad vid SciLifeLab i Solna. NGI - Stockholm Genomics Production tillhandahåller storskalig sekvensering, samt kunskap om denna, till svenska forskargrupper. Verksamhetens mål är att främja svensk forskning inom...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi är intresserade av att studera sambandet mellan neuropsykiatriska sjukdomar, inklusive både psykiatriska sjukdomar och neuroutvecklingsstörningar, och somatiska sjukdomar senare i livet så som cancer, infektioner, hjärtkärlsjukdomar och neurodegenerativa störningar. Som postdoktor förväntas du ta en ledande roll i hela...


  • Solna, Sweden Karolinska Inst Full time

    Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet? Det nyligen startade Picton-laboratoriet, i samarbete med El Manira- och Lallemend-laboratorierna vid Institutionen för neurovetenskap, söker en postdoktor. Vi söker en entusiastisk postdoktor som är intresserad av att studera sensorimotoriska kretsar med hjälp av elektrofysiologiska, molekylära...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Team Erica Zeglio söker en postdoktor inom området in vitro elektrofysiologi, med ett fokus på tryckta mikroelektroder för extracellulär registrering av hjärtceller. Till stora delar kommer kandidaten arbeta med hjärtcellsmodeller och kommer utveckla och optimera in vitro elektrofysiologiska inspelningsplattformar. Kandidaten kommer...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi genomför nu flera projekt fokuserat på barncancer och genetiska cancersyndrom, både avseende etiologi, prognos och långtidseffekter, och söker nu ytterligare en postdoktoral forskare till enheten. Förutom planerade projekt finns möjligheter att utveckla och genomföra egna projektidéer, där tillgången till data för omfattande...


  • Solna, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    Arbetsuppgifter Avdelningen för Affinitetsproteomik på Institutionen för kth.se/sv/pro rekryterar nu tre postdocs till olika projekt inom affinitetsproteomik-baserad multiplex protein och antikroppsprofilering av humana kroppsvätskor. Alla projekt kombinerar tillämpning av en experimentell array-baserad metod för att generera stora mängder komplext...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Det är en fördel om du är bekant med det humana papillomvirusområdet, vara skicklig i cellodling enligt ovan. Teoretiska och praktiska kunskaper om hur man utför viabilitets-, proliferations-, apoptos- och cytotoxicitetstester är till nytta. Likaså är det nödvändigt att vara skicklig i många laboratorietekniker som specificerats...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Som postdoktoral forskare kommer du att ansvara för dina specifika forskningsprojekt, interaktionerna i nanoskala mellan de extracellulära matriskomponenter, med innovativa experimentella metoder och förväntas utveckla innovativa experimentella metoder, kreativa projektidéer och därefter forskningslinjer i teori och praktik för att...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vår vision är att använda insikter från cytotoxisk lymfocytbiologi och vävnadsresidens för att förbättra cellulär immunterapi av solida tumörer. Våra team har nyligen publicerat publikationer med hög effekt om jämförande T-cellsdifferentieringsmarkörer (Zwijnenburg et al., Immunity 2023) och mekanismen för vävnadsresident...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll En viktig uppgift för den utvalda kandidaten kommer att vara att bidra konceptuellt och metodologiskt till forskningen inom detta VR-finansierade projekt under handledning av docent Davide L Vetrano. Stor vikt kommer att läggas vid utveckling och validering av nya statistiska metoder som tillämpas på det specifika projektets...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Du kommer främst att vara involverad i ett forskningsprogram som fokuserar på miljö- och yrkesmässig bullerexponering i relation till förekomst av typ 2 diabetes, inklusive mediering av övervikt/fetma och sömnstörningar. Syftet är att uppskatta exponering-responssamband och att bedöma effektmodifiering av miljö- och yrkesmässig...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Projektet fokuserar på utvecklingen av läkemedel som är inriktade på amyloid- och tau-patologi för AD och andra neurodegenerativa sjukdomar. Vi kombinerar strukturbiologiska tekniker som datorstödd läkemedelsdesign, biofysiska och biokemiska metoder för att utveckla läkemedelskandidater. Vi undersöker biologiska effekter av dessa...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Tjänsten kommer att omfatta arbete med bioinformatik, maskininlärning av transkriptomdata inom ett europeiskt projekt finansierat av Innovative Medicines Initiative Joint Undertaking on immunmedierade sjukdomar där Karolinska Institutet är partner under koordinering av Prof Marta E. Alarcón-Riquelme och med samarbete från...


  • Solna, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    Arbetsuppgifter De postdoktorerna kommer att samarbeta i ett projekt som fokuserar på att studera transportprocesserna för polymer- och kolloidsystem i flockulerade cellulosafibernätverk vid olika koncentrationer. Målet är att öka vår kunskap för att underlätta och optimera industriella processer. För att uppnå detta kommer forskningen att...

  • Sjukhusgenetiker

    2 weeks ago


    Solna, Sweden Karolinska Universitetssjukhuset Full time

    Sjukhusgenetiker Publicerad för 4 dagar sedan Ort: Solna Omfattning: Heltid Organisation: Karolinska Universitetssjukhuset Sista ansökningsdag: 3 maj 2024 Ansök(Extern länk) Just nu söker vi dig som är biomedicinare, molekylärbiolog, kemist eller ingenjör, har disputerat inom genetik, genomik eller annat relevant område och vill tillämpa...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll En viktig uppgift för den som erhåller tjänsten blir att bidra konceptuellt och metodologiskt till forskningen inom detta VR-finansierade projekt under handledning av docent Davide L Vetrano (huvudhandledare) och professor Bengt Winblad. Dessutom kommer personen att ha möjlighet att initiera egna projekt. Produktion av rapporter och...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi söker två postdoktorer som brinner för avancerad mikroskopi och/eller genomanalys och som vill göra grundläggande upptäckter inom cancerforskning. Personerna ska vara öppna för att dela med sig av sin expertis och kompletterande färdigheter, vilket kommer att leda till att de stärker sina egna karriärer såväl som vår...


  • Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi söker en mycket motiverad och ambitiös forskningsspecialist med gedigen bakgrund inom området hjärtregeneration. Forskningsprojektets fokus är att karakterisera rollen av täta fogar (tight junctions) vid aktivering och differentiering av epikardiala stamceller samt för att etablera ”live immaging” metoder och transgena linjer...