Forskare (Datavetare), Core Facilities

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.Core Facilities är en öppen universitetsgemensam forskningsinfrastruktur för forskning inom Life Science. Vi finns på Sahlgrenska akademin och erbjuder tillgång till några av Sveriges mest avancerade tekniker och analysverktyg för forskning inom t.ex. medicin, biomedicin och kliniska studier. Alla våra enheter har stark nationell och internationell profil och vi är del av bland annat SciLifeLab. Enheterna vid Core Facilities är utrustade med avancerade instrument och specialiserade experter med hög kompetens. Utöver högklassig forskningsservice erbjuder vi också teoretisk utbildning och praktiska kurser. Vår infrastruktur är öppen för alla forskare – både vid Göteborgs universitet och vid andra lärosäten samt privat industri i Sverige och internationellt.

Letar du efter en spännande multidisciplinär bioinformatisk och datavetenskaplig utmaning? Proteomics Core Facility är en open access-infrastruktur organiserad inom Core Facilities, Sahlgrenska akademin vid Göteborgs universitet, www.cf.gu.se . Plattformen använder biologisk masspektrometri (MS) för protein analys och tillhandahåller vetenskaplig expertis och avancerade instrument för forskningsstöd av hög kvalitet. MS-plattformen är en del av den nationella BIOMS-infrastrukturen, www.bioms.se , med finansiering från Vetenskapsrådet samt en del av SciLifeLabs nationella resurs för unika teknologier, www.scilifelab.se , inom enheten Glycoproteomics and MS Proteomics.

Proteomics Core Facility erbjuder ett brett utbud av proteomik-metoder för små och stora studier med MS analys för kvantifiering och jämförelser samt specialiserad analys inom glykomik och glykoproteomik. Vi använder Orbitrap- och tims -TOF-instrument som är kopplade till nano-LC-system för att svara på avancerade biologiska frågor, för upptäckt av biomarkörer och biologiska processer associerade med olika sjukdomar. Vi stödjer forskning för att öka den biologiska förståelsen av glykosyleringar . Nyligen har vi ökat vårt fokus inom området klinisk proteomik och precisionsmedicin.

Infrastrukturens personal har biologisk, medicinsk, teknisk och naturvetenskaplig bakgrund och vårt dagliga arbete är mer och mer beroende av framsteg inom avancerad mjukvara, skript, programmering, dataöverföring etc. Våra arbetsflöden, datahantering, bearbetning, MS dataanalys, tolkning, datadelning och så vidare, är i behov av en multidisciplinär vetenskaplig datorspecialist som kan stödja många delar av infrastrukturens forskardrivna projekt. Ditt bidrag kommer att vara viktigt för life science, medicinsk och biologisk utveckling.

Rollen kräver en person som brinner för utveckling av datorsystem och leverans av mjukvarulösningar för pipelines och bearbetning till dataanalys och tolkning. Rollen inkluderar att stödja, driva och utveckla vår förmåga inom kvantitativ proteomik och karakterisering av proteiners glykosyleringar. Vi behöver utöka vår kompetens för datahantering inom precisionsmedicin, klinisk proteomik och multiomik (t.ex. transkriptomik, proteomik, metabolomik) och du kommer att interagera med ett multidisciplinärt team av datavetare i vårt nätverk och infrastruktur.

Arbetsuppgifter

• Utvärdering, implementering och underhåll av nya MS-dataprogram och applikationsverktyg samt utveckling av programkod för analys, integration och visualisering av data.
• Strukturering av lokala och globala datahanteringsprocesser och lösningar för datadelning.
• Tillhandahålla högkvalitativt bioinformatiskt forskningsstöd och säkerställa optimal användning av MS-data.
• Support inom Proteomics Core Facility med ad hoc-analys och pipelines.
• Kombinera data mellan öppen källkod och/eller kommersiellt tillgängliga mjukvaruplattformar för datavalidering och sortering där det är nödvändigt att skriva skript och programmera.
• Bistå med kvalitetskontroll och statistik av MS-analyserna.
• Samarbeta med forskare och gruppmedlemmar i många aspekter av databehandling och hantering.

Ansvaret och uppgifterna kan fördelas i gruppen efter kompetens och tilldelade resurser.

Kvalifikationer

• Du måste inneha doktorsexamen i datavetenskap, bioinformatik, statistik eller relevant vetenskapligt område inom omics.
• Du måste ha erfarenhet av Unix/Linux operativsystem och R/ Matlab, samt ett etablerat allmänspråk, Python är att föredra.
• Du måste vara mångsidig inom informationsteknik.
• Du ska kunna arbeta självständigt såväl som en del av ett team.
• Du bör ha erfarenhet av att hantera och analysera stora datamängder.
• Du bör ha erfarenhet av relevanta mjukvaruversionsverktyg som Javascript, C/C++, SQL/NoSQL-databasering och t.ex. Git/ Github.
• Erfarenhet av att använda High Performance Computing-plattformar på plats eller i molnet (AWS, GCP etc ) är önskvärt.
• Demonstrerad erfarenhet inom kärnkompetensområdena: masspektrometribaserad omik, multivariat och/eller högdimensionell dataanalys (-omics), datahantering och visualisering önskas.
• Erfarenhet av andra molekylära profileringsteknologier (t.ex. NGS) eller multiomics är meriterande.
• Tidigare erfarenhet av att arbeta i multidisciplinär miljö är meriterande.

Stor vikt läggs vid personlig lämplighet, flexibilitet och god kommunikations- och interaktionsförmåga.

För övrig information och för att söka anställningen se den fullständiga annonsen på www.gu.se.

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.