Postdoktor inom eukaryot-RNA-genomik

2 weeks ago

Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

Din roll

Den tillgängliga postdoktorala positionen syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala genom att kombinera experimentellt arbetssätt med beräkningsmetoder.

Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin Verstrepen (Leuven) och prof. Julien Gagneur (München). EPIC kommer att kombinera användningen av genomisk, syntetisk biologi, maskininlärning och evolutionära tillvägagångssätt med målet att förstå den fullständiga regleringskoden för genuttryck för S. cerevisiae och andra eukaryoter.

Den rekryterade kandidaten kommer att fokusera på kartläggning och förutsägelse av mRNA-gränser i en aldrig tidigare skådad skala. Kandidaten kommer också att använda den genererade informationen för att kvantifiera och förutsäga hur mRNA-variationer leder till divergerande mRNA-öden. Kandidaten kommer att integrera olika experimentella- och beräkningsbaserade metoder för att slutföra projektet, inklusive genomik, jästgenetik, högkapacitetsbiologiska tillvägagångssätt och bioinformatik. Kandidaten kommer att utföra orginell forskning inom transkriptomik och beräkningsbiologi, och skaffa de nödvändiga experimentella och beräkningsfärdigheter som krävs för att slutföra projektet.

Kandidaten förväntas kommunicera de vetenskapliga resultaten genom att upprätta vetenskapliga artiklar och delta i vetenskapliga möten. Den idealiska kandidaten kommer att delta i teamets allmänna uppgifter och effektivt kommunicera med forskare med olika bakgrund i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö.

Arbetsspråket är engelska.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Utöver ovan nämnda krav för tjänsten:

Sökande till denna tjänst bör ha en doktorsexamen i molekylärbiologi, bioteknik, genetik eller liknande område. Den framgångsrike sökande bör ha erfarenhet av att tolka biologiska data och experimentellt testa sin hypotes med ett stort intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling. Den lämplige kandidaten bör ha lång erfarenhet av molekylärbiologiska metoder såsom RNA-Seq, ATAC-Seq, molekylär kloning och RNA-biologi. Forskningserfarenhet av storskaliga analyser och bioinformatik (NGS, batch- och/eller R/Python-skriptspråk) är också nödvändigt. Ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling, nytänkande och kreativt tänkande är väsentligt. God samarbetsförmåga och förmåga att arbeta i team är en förutsättning.

Meriterande för tjänsten:

Tidigare erfarenhet av jästgenetik, transkription/post-transkriptionell mRNA-reglering, högkapacitetsrobotik och syntetisk biologi är meriterande.

Vid anställningen kommer särskild vikt att läggas vid vetenskaplig skicklighet av relevans för projektet och vid tidigare forskningserfarenhet.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

  • Postdoktor inom eukaryot-RNA-genomik

    3 months ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Den tillgängliga postdoktorala positionen syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala genom att kombinera experimentellt arbetssätt med beräkningsmetoder. Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC -...

  • Postdoktor inom eukaryot-RNA-genomik

    4 weeks ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Den tillgängliga postdoktorala positionen syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryot genuttryck i en aldrig tidigare skådad skala genom att kombinera experimentellt arbetssätt med beräkningsmetoder. Kandidaten kommer att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC -...

  • Postdoktor inom RNA-biologi och genomik

    2 months ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll I din roll som Postdoktor kommer du att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptomomfattande tillvägagångssätt (baserade på bulk- och encells-RNA-sekvensering) för att studera genuttryck och transkriptreglering med hjälp av data erhållna från patienter och cellmodeller. Detta projekt fokuserar på rollerna för regulatoriska...

  • Postdoktor inom RNA-biologi och genomik

    4 weeks ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll I din roll som Postdoktor kommer du att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptomomfattande tillvägagångssätt (baserade på bulk- och encells-RNA-sekvensering) för att studera genuttryck och transkriptreglering med hjälp av data erhållna från patienter och cellmodeller. Detta projekt fokuserar på rollerna för regulatoriska...

  • Postdoktor i utvecklings- och metabolisk biologi

    2 weeks ago

    Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Som postdoktor kommer du att studera de transkriptomiska profilerna av genetiskt spårade intervertebrala diskceller och fettvävnadsceller. Forskningsarbetet inkluderar analys av singelcell/kärnadata, konfokal avbildning, immunfluorescens och standardtekniker för molekylärbiologi. Du förväntas ha förmågan att självständigt driva...

  • Postdoktor i tumörimmunologi

    2 weeks ago

    Huddinge Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Mjösbergsgruppen studerar utvecklingen, regleringen och funktionen av medfödda lymfoida celler (ILC), i människor, och hur dessa celler bidrar till patologi i slemhinnor som lunga och tarm. Studierna är translationella eftersom de involverar avancerade molekylära och cellulära immunologiska undersökningar av mänskliga vävnadsprover för...

  • Forskningsingenjör inom storskalig sekvensering

    2 weeks ago

    Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Anställningen gäller en tjänst vid Genomics Production som är en del av National Genomics Infrastructure - Stockholm, lokaliserad vid SciLifeLab i Solna. NGI - Stockholm Genomics Production tillhandahåller storskalig sekvensering, samt kunskap om denna, till svenska forskargrupper. Verksamhetens mål är att främja svensk forskning inom...

  • 2 postdoktorer inom psykiatrisk epidemiologi

    2 weeks ago

    Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi är intresserade av att studera sambandet mellan neuropsykiatriska sjukdomar, inklusive både psykiatriska sjukdomar och neuroutvecklingsstörningar, och somatiska sjukdomar senare i livet så som cancer, infektioner, hjärtkärlsjukdomar och neurodegenerativa störningar. Som postdoktor förväntas du ta en ledande roll i hela...

  • Vikarierande underläkare till Klinisk genetik och genomik

    2 weeks ago

    Solna Municipality, Sweden Karolinska Full time

    Vikarierande underläkare till Klinisk genetik och genomik Nu söker vi underläkare till Klinisk genetik och genomik vid Karolinska universitetssjukhuset. Om du vill arbeta med högspecialiserad vård och vara med och bidra i en stimulerande miljö är du välkommen med din ansökan Du erbjuds Varierat arbete på vår patientmottagning under...

  • Postdoktor inom området in vitro elektrofysiologi

    2 weeks ago

    Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Team Erica Zeglio söker en postdoktor inom området in vitro elektrofysiologi, med ett fokus på tryckta mikroelektroder för extracellulär registrering av hjärtceller. Till stora delar kommer kandidaten arbeta med hjärtcellsmodeller och kommer utveckla och optimera in vitro elektrofysiologiska inspelningsplattformar. Kandidaten kommer att...

  • Forskningsingenjör inom storskalig sekvensering

    2 months ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Anställningen gäller en tjänst vid Genomics Production som är en del av National Genomics Infrastructure - Stockholm, lokaliserad vid SciLifeLab i Solna. NGI - Stockholm Genomics Production tillhandahåller storskalig sekvensering, samt kunskap om denna, till svenska forskargrupper. Verksamhetens mål är att främja svensk forskning inom...

  • Forskningsingenjör inom storskalig sekvensering

    4 weeks ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Anställningen gäller en tjänst vid Genomics Production som är en del av National Genomics Infrastructure - Stockholm, lokaliserad vid SciLifeLab i Solna. NGI - Stockholm Genomics Production tillhandahåller storskalig sekvensering, samt kunskap om denna, till svenska forskargrupper. Verksamhetens mål är att främja svensk forskning inom...

  • Postdoktor i cancerepidemiologi

    2 weeks ago

    Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi genomför nu flera projekt fokuserat på barncancer och genetiska cancersyndrom, både avseende etiologi, prognos och långtidseffekter, och söker nu ytterligare en postdoktoral forskare till enheten. Förutom planerade projekt finns möjligheter att utveckla och genomföra egna projektidéer, där tillgången till data för omfattande...

  • ST-läkare i klinisk genetik till Klinisk genetik och genomik

    2 days ago

    Solna, Sweden Karolinska Full time

    ST-läkare i klinisk genetik till Klinisk genetik och genomik Är du intresserade av klinisk genetik och genomik? Som ST-läkare hos oss arbetar du med erfarna kollegor och får tillgång till avancerad genetisk expertis. Du kan bidra till att förbättra vårdkvaliteten samtidigt som det finns möjlighet till egen kompetensutveckling och spännande...

  • 2 postdoktorer inom psykiatrisk epidemiologi

    3 months ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi är intresserade av att studera sambandet mellan neuropsykiatriska sjukdomar, inklusive både psykiatriska sjukdomar och neuroutvecklingsstörningar, och somatiska sjukdomar senare i livet så som cancer, infektioner, hjärtkärlsjukdomar och neurodegenerativa störningar. Som postdoktor förväntas du ta en ledande roll i hela...

  • 2 postdoktorer inom psykiatrisk epidemiologi

    4 weeks ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Vi är intresserade av att studera sambandet mellan neuropsykiatriska sjukdomar, inklusive både psykiatriska sjukdomar och neuroutvecklingsstörningar, och somatiska sjukdomar senare i livet så som cancer, infektioner, hjärtkärlsjukdomar och neurodegenerativa störningar. Som postdoktor förväntas du ta en ledande roll i hela...

  • Vikarierande underläkare till Klinisk genetik och genomik

    4 weeks ago

    Solna, Sweden Karolinska Full time

    Vikarierande underläkare till Klinisk genetik och genomik Nu söker vi underläkare till Klinisk genetik och genomik vid Karolinska universitetssjukhuset. Om du vill arbeta med högspecialiserad vård och vara med och bidra i en stimulerande miljö är du välkommen med din ansökan! Du erbjuds Varierat arbete på vår patientmottagning under...

  • Vikarierande underläkare till Klinisk genetik och genomik

    1 month ago

    Solna, Sweden Karolinska Full time

    Vikarierande underläkare till Klinisk genetik och genomik Nu söker vi underläkare till Klinisk genetik och genomik vid Karolinska universitetssjukhuset. Om du vill arbeta med högspecialiserad vård och vara med och bidra i en stimulerande miljö är du välkommen med din ansökan! Du erbjuds Varierat arbete på vår patientmottagning under...

  • Postdoktor till

    2 weeks ago

    Solna Municipality, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Det är en fördel om du är bekant med det humana papillomvirusområdet, vara skicklig i cellodling enligt ovan. Teoretiska och praktiska kunskaper om hur man utför viabilitets-, proliferations-, apoptos- och cytotoxicitetstester är till nytta. Likaså är det nödvändigt att vara skicklig i många laboratorietekniker som specificerats ovan....

  • Postdoktor inom området in vitro elektrofysiologi

    3 months ago

    Solna, Sweden Karolinska Institutet Full time

    Din roll Team Erica Zeglio söker en postdoktor inom området in vitro elektrofysiologi, med ett fokus på tryckta mikroelektroder för extracellulär registrering av hjärtceller. Till stora delar kommer kandidaten arbeta med hjärtcellsmodeller och kommer utveckla och optimera in vitro elektrofysiologiska inspelningsplattformar. Kandidaten kommer...