Postdoktor i molekylär ekologi

Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med personal och studenter från hela världen.  Vår forskning omfattar allt från evolutionär ekologi och genetik till studier av ekosystem. Se vidare

Vi söker nu en postdoktor i molekylär ekologi till programmet för Zooekologi.

Postdoktorn kommer att arbeta inom programmet för Zooekologi vid Institutionen för ekologi och genetik (IEG), Uppsala universitet. Personen kommer att bli del av Elin Videvalls forskargrupp, som studerar mikrobiom hos vilda djur, samt arbeta med Frank Johansson, som forskar på akvatiska insekter. Projektet innefattar även samarbete med Richard Svanbäck och Katerina Guschanski. Värdinstitutionen IEG ligger i direkt anslutning till SciLifeLab ) och vi har tillgång till bioinformatiska resurser via UPPMAX ).

Projektbeskrivning
Vi söker en postdoktoral forskare i 2,5 år till projektet "Insekter som vektorer for antimikrobiell resistans i stadslandskap". Det övergripande målet är att öka förståelsen för insekters (Chironomidae: fjädermyggor) roll i spridning och dynamik av antimikrobiell resistens (AMR) från avloppsreningsverk. Projektet använder en unik kombination av fältundersökningar och laboratorieexperiment. Fältarbetet syftar till att kartlägga de spatiala mönstren av AMR i urbana miljöer, medan kontrollerade laboratorieexperiment kommer att belysa mekanismer och processer bakom AMR-överföring både i landskapet och i näringsvävar. En stor del av arbetet kommer att bestå av metagenomiska analyser och laboratorieexperiment på fjädermyggor.

Arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna innefattar att bioinformatiskt assemblera "metagenome-assembled genomes" (MAGs) från shotgun-metagenomisk sekvensdata, utföra taxonomisk klassificering samt identifiera plasmider och antimikrobiella resistensgener. Analyserna omfattar bl.a. multivariata statistiska metoder. Dessutom kommer postdoktorn att planera och genomföra kontrollerade laboratorieexperiment på fjädermyggor och andra akvatiska insekter för att studera överföring av AMR mellan individer, generationer och arter. Denna del av arbetet innefattar uppfödning av akvatiska insekter insamlade i fält, upprätthållande av faktoriella experimentella upplägg samt analys av AMR-överföring med hjälp av strykningar på agarplattor.

Kvalifikationskrav
Doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom mikrobiologi, molekylärbiologi, bioinformatik, miljögenomik, eller ett närliggande område. Examen ska vara uppfylld senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.

Vi söker en motiverad, självständig och skicklig forskare som kan driva projektet framåt. Den ideala kandidaten är en samarbetsinriktad lagspelare med ett starkt intresse för mikrobiell överföring hos djur (horisontellt och vertikalt). Kandidaten bör ha erfarenhet av en eller flera av ovan nämnda arbetsuppgifter samt dokumenterat vetenskapligt skrivande på engelska och publicering i vetenskapliga tidskrifter.

Meriterande
Kandidaten bör ha erfarenhet av analys av metagenomisk shotgun-data. Erfarenhet av rekonstruktion av MAGs och identifiering av AMR gener är mycket meriterande. Goda kunskaper i programmeringsspråk Python, R eller Bash) och erfarenhet av arbete i Unix/Linux är en fördel. Erfarenhet av laboratorieodling av akvatiska insekter samt genomförande av kontrollerade livscykel- och/eller faktoriella laboratorieexperiment är meriterande. Erfarenhet av agarplatt-tester är också önskvärt.

Om anställningen
Tidsbegränsad anställning i 30 månader, med möjlighet till förlängning upp till max 36 månader, enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av
Elin Videvall, eller Frank Johansson,

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla 1) ett brev som beskriver dig själv, dina forskningsintressen och varför du vill ha tjänsten (max två sidor), 2) ditt kompletta CV inklusive publikationslista, 3) en kopia av din doktorandexamen samt doktorsavhandling, 4) namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner. Ansökan bör skrivas på engelska.

Välkommen med din ansökan senast den 5:e December 2025. UFV-PA 2025/3200.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Tillbaka till lediga jobb