Beräkningsbiofysiker

Kungliga Tekniska Högskolan söker en erfaren forskare till ett ledande tekniskt universitet.

Anställningen gäller tillsvidare med sex månaders provanställning.

Anställningen inleds med en provanställning, varefter den kan omvandlas till en fast anställning om allt går bra. Anställningen är placerad i säkerhetsklass och därför kommer den ansökande att genomgå en säkerhetsprövning innan beslut om anställning fattas.

Som forskare vid Kungliga Tekniska Högskolan kommer du att arbeta på vår forskningsenhet för beräkningsbiofysik. Vår enhet sysslar med molekylär dynamik simuleringsutvecklingar, där vi använder klassisk molekylär dynamik för att studera komplexa system som membranproteiner. Vi fokuserar även på utvecklingen av ny teknik och metoder för att öka simuleringens effektivitet.

Vid detta arbete har du stort handlag över projektets riktning och innehåll. Du kommer att arbeta nära andra forskare inom teamet, samt delta i internationella samarbetsprojekt. Dessutom kommer du att deltaga i undervisning och handledning av studenter.

• Leda ett projekt för att utveckla förmågan hos molekylär dynamik simuleringsprogram för att göra det möjligt att förstå samspelet mellan strukturen, dynamiken och funktionen hos flera membranproteiner.
• Aktivera nya 'enhanced sampling' metoder för att utöka möjligheterna hos simuleringar av klassisk molekylär dynamik, vilket kommer att möjliggöra konformationell sampling av membranproteiner såsom G-proteinkopplade receptorer, transportörer och jonkanaler.
• Implementera protokoll från de ovan nämnda metoderna i simuleringspaketet GROMACS och leda arbetet med att komma med protokoll som kommer att anpassa dessa metoder för att möjliggöra konformationell sampling av membranproteiner.
• Förbättra programmets prestanda och korrigera eventuella fel och brister.