Matematisk doktorand

2 days ago


Stockholm, Stockholm, Sweden Karlstad University Full time
Jobbbeskrivning

Forskarutbildningsämne: Tillämpad matematik och beräkningsmatematik, inriktning matematisk statistik

Kryo-EM är en avbildningsmetod som använder bilder från elektronmikroskop för att rekonstruera 3D-strukturen hos biologiska molekyler. Bilderna från elektronmikroskopet är dock väldigt brusiga, vilket kompenseras genom insamling av en stor mängd data vilket i sin tur leder till höga insamlingskostnader.

Detta projekt föreslår en ny metod för rekonstruktion från kryo-EM-bilder med hjälp av generativa modeller (som AlphaFold 3). Dessa modeller innehåller värdefull information om molekylära strukturer men kan också hallucinera. Genom att istället använda dessa modeller som apriorifördelningar i ett bayesianskt ramverk kombinerar vi information från två olika källor (generativa modeller och kryo-EM) för att rekonstruera mer tillförlitliga 3D-strukturer.

Projektets syfte

  • Förbättra metoden för rekonstruktion av 3D-strukturer från kryo-EM-bilder med hjälp av generativa modeller.
  • Utveckla en ny metod för att kombinera information från två olika källor (generativa modeller och kryo-EM) för att rekonstruera mer tillförlitliga 3D-strukturer.

Arbetsuppgifter

  • Forskning och utveckling av ny metod för rekonstruktion från kryo-EM-bilder med hjälp av generativa modeller.
  • Dokumentation och presentation av resultaten.

Beräkningsmatematiker behörighet

  • För att bli antagen till forskarutbildning (kap 7 39 § högskoleförordningen) krävs att den sökande har grundläggande behörighet:
  • På något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    Matematiska institutionen vid Stockholms universitet har med sin långa tradition av excellent forskning en framskjuten plats inom skandinavisk matematik.Institutionen består av tre avdelningar: matematik, beräkningsmatematik och matematisk statistik. Forskare som arbetar vid avdelning matematisk statistik har kompetens som spänner över många olika...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    Stockholms universitet har en lång tradition av utmärkt forskning och är en ledande institution inom skandinavisk matematik.ForskningsprojektVi söker särskilt rekrytera doktorander till följande projekt:Computational methods for complex SV detection using sequencing data (handledare Kristoffer Sahlin)Explainable AI: Characterizing fidelity and...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    Stockholms universitet är ett ledande forskningsuniversitet som arbetar för att bidra till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.Vid Institutionen för matematiska vetenskaper bedrivs forskning och utbildning inom matematik, beräkningsvetenskap och matematisk statistik. Vi är en dynamisk enhet...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    Matematiska institutionen vid Stockholms universitet har med sin långa tradition av excellent forskning en framskjuten plats inom skandinavisk matematik.Institutionen består av tre avdelningar: matematik, matematisk statistik och beräkningsmatematik. Forskare som arbetar vid avdelning matematik har kompetens som spänner över många olika grenar av...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    ProjektbeskrivningForskarutbildningsämne: MatematikTvå doktorandtjänster utlyses med följande specialiseringar.För detaljer, kontakta handledaren. Ansökningar inom andra specialiseringar tas också emot; för detaljer, kontakta programansvarig för doktorsprogrammet.Kommutativ algebra (handledare: Mats Boij)Sannoliketsteori och matematisk fysik...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    Matematiska institutionen vid Stockholms universitet har med sin långa tradition av excellent forskning en framträdande plats i skandinavisk matematik.Institutionen består av tre avdelningar: Matematik, Matematisk statistik och Beräkningsmatematik. Forskningen vid Avdelningen för beräkningsmatematik omfattar många olika områden inom numerisk analys,...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska högskolan Full time

    Kungliga Tekniska högskolan (KTH) är ett av Sveriges främsta lärosäten och erbjuder en unik möjlighet att forska inom det senaste området av artificiell intelligens och 6G-nätverk.ProgrambeskrivningVår doktorandprogram kombinerar teoretisk forskning med praktiska experiment, vilket ger dig möjlighet att bidra till både grundläggande och...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    AnsökningskriterierVi söker en högt motiverad doktorand med en stark bakgrund inom både miljökemi och datavetenskap. Kandidaten bör ha goda kunskaper om statistik, programmeringsspråk och matematisk analys. Erfarenhet av att arbeta med XAI och ML-modeller är meriterande. Vi erbjuder en möjlighet att arbeta i en samarbetsinriktad och stödjande...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    Vill du vara med och utveckla nya tekniker för att bättre förstå komplexa system? Då är detta det rätta läget för dig! Som doktorand på KTH kommer du att arbeta med att ta fram en ny metod för rekonstruktion av 3D-strukturen hos biologiska molekyler. Genom att använda generativa modeller som apriorifördelningar i ett bayesianskt ramverk kommer...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Bifoga personligt brev och CV samt de bilagor som efterfrågas i ansökningsformuläret. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.Anvisningar för sökande finns på webbsidan:...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska högskolan Full time

    Vår forskargrupp vid Kungliga Tekniska högskolan (KTH) är engagerade i utvecklingen av nya tekniker och metoder inom artificiell intelligens och 6G-nätverk.Sammanfattning av forskningsprojektetVår forskning fokuserar på att undersöka hur man kan använda artificiell intelligens för att förbättra prestandan och effektiviteten hos 6G-nätverk. Vi...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    ProjektbeskrivningForskarutbildningsämne: tillämpad matematik och beräningsteknik, inriktning matematisk statistikKryo-EM är en avbildningsmetod som använder bilder från elektronmikroskop för att rekonstrukera 3D-strukturen hos biologiska molekyler.Bilderna från elektronmikroskopet är dock väldigt brusiga, vilket kompenseras genom insamling av en...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska högskolan Full time

    Är du intresserad av att forska inom det senaste området av artificiell intelligens och 6G-nätverk? Vi söker doktorander till vårt program som kombinerar teoretisk forskning med praktiska experiment.Om forskningsprojektetVår forskning fokuserar på MAC-och länklageraspekter av radionätverk, samtidigt som vi beaktar fysiska lagren och nätverkslagrens...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    ProjektbeskrivningForskarutbildningsämne: Elektro-och systemteknikBland flera nya funktioner som kommer att definiera kommande 6G-nätverk är det ingen tvekan om att AI är bland de viktigaste basteknologierna.Forskning inom detta område utforskar för närvarande tre huvudriktningar: 1) Ersätta specifika funktioner i radionätverksstacken med AI. 2)...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Kungliga Tekniska Högskolan Full time

    ProjektbeskrivningForskarutbildningsämne: DatalogiVi söker två högt motiverade personer för att ta en doktorsexamen i algoritmer och dataanalys.Forskargruppen utvecklar praktiska datavetenskapliga algoritmer med bevisbara garantier, genom att utnyttja teoretiska insikter för att erhålla toppmoderna praktiska algoritmer. För närvarande har vi fokus...


  • Stockholm, Stockholm, Sweden Stockholms Universitet Full time

    Zoologiska institutionen är en av de äldsta institutionerna vid Stockholms universitet med en lång historia av grundläggande och tillämpad djurforskning, från leddjur till stora däggdjur.Institutionen är en dynamisk forskningsmiljö och med ca 80 forskare, doktorander och administrativ personal verksamma vid institutionen. Det finns flera grupper som...