Bioinformatiker - Clinical Genomics Uppsala
4 weeks ago
Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 500 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: Vill du göra skillnad för patienter med cancer? Vi söker en bioinformatiker för att driva utveckling av bioinformatiska analyser för att etablera ny avancerad genetisk diagnostik för sjukvården. Clinical Genomics Uppsala är en del av plattformen Clinical Genomics inom Science for Life Laboratory. Det bioinformatiska arbetet inom verksamheten är förlagt till Uppsala universitet, medan laboratoriearbetet utförs vid kliniska laboratorier på Uppsala Akademiska Sjukhus. Enhetens uppdrag är att bedriva service och utveckling för kliniknära forskning, samt att ta fram och tillhandahålla kliniska analyser, främst med hjälp av storskalig DNA-sekvensering. I multidisciplinära team med bioinformatiker, genetiker och läkare levererar faciliteten kliniska bedömningar av upptäckta genetiska varianter. De implementerade analyserna är framför allt inriktade mot olika former av cancer, ärftliga sjukdomar och mikrobiologi och över 8000 kliniska prover analyseras per år med de metoder som faciliteten tillhandahåller. Eftersom genetisk diagnostik efterfrågas inom allt fler kliniska discipliner pekar prognosen på en stark tillväxt även kommande år. Arbetsuppgifter Faciliteten söker en bioinformatiker på heltid för att delta i utvecklingen av analyser riktade mot cancer. Tjänsten är ett vikariat på ett år i samband med en tjänstledighet. Möjlighet till förlängning finns. Arbetsuppgifterna definieras utifrån kompetens och intresse, men kommer att vara inriktade mot utveckling och underhåll av diagnostiska analyser vid olika cancersjukdomar, främst inom solida tumörer. Analyserna kommer till stor del att innefatta breda genpaneler för detektion av genetiska varianter som påverkar diagnos, prognos och behandling av cancer utifrån tumörprov eller s.k. liquid biopsies. Den sökande kommer att vara inblandad i kontinuerlig utvärdering, utveckling och automation av robusta bioinformatiska analyser för att processa short- eller long-read sekvens för kliniskt bruk. En del av uppdraget kommer att omfatta arbete med effektiv datahantering, automation och visualisering för att skapa effektiva dataflöden och för att underlätta klinisk tolkning och rapportering. Arbetet utförs i nära samarbete med kliniskt verksam personal och i samverkan med Genomics Medicine Sweden (GMS). Vi ser även positivt på sökande som är intresserade av arbetsuppgifter som omfattar databashantering och mjukvaruutveckling eftersom vi kontinuerligt strävar efter att utveckla enhetens analyser, IT-infrastruktur och arbetssätt. Vår pipelineutveckling sker framförallt med Python och Snakemake och den sökande kommer i sitt arbete ha möjlighet att bidra till projektet Hydra genetics ( En särskilt viktig aspekt är samarbetet med anställda inom sjukvården och förmåga att utveckla analysmetoder för angelägna kliniska frågeställningar. Eftersom verksamheten hanterar känsliga kliniska data är frågor kring datasäkerhet viktiga. Faciliteten har därför ett eget kluster där arbetet i huvudsak kommer att utföras. Klinisk genomik är ett nytt och intensivt forskningsområde och den anställde kommer att ha möjlighet att bidra till publicering och presentation av både tekniska och biologiska resultat och metoder. Den anställde kommer att jobba tillsammans med andra bioinformatiker, läkare, sjukhusgenetiker och molekylärbiologer inom vår facilitet och även i nationella och internationella samarbeten. Kvalifikationskrav:
- Mastersexamen i ämne med anknytning till tjänsten t.ex. bioinformatik, bioteknik, datavetenskap eller motsvarande fält.
- Dokumenterad förmåga inom ett eller flera scriptspråk (t ex Python/Bash/Perl)
- Erfarenhet av att arbeta med NGS i linuxmiljö på beräkningskluster
- Kännedom om git, conda och pipelineverktyg som Snakemake eller Nextflow
- Erfarenhet av containermjukvara, Singularity (Apptainer)/Docker/Podman
- Grundläggande kunskaper om databashantering
- God förmåga att kommunicera på svenska och engelska
-
Postdoktor inom Bioinformatik
3 weeks ago
Uppsala, Sweden Uppsala universitet Full timePostdoktor inom Bioinformatik Vill du arbeta med forskning, med stöd av kompetenta och trevliga kollegor i en internationell miljö? Vill du ha en arbetsgivare som satsar på ett hållbart medarbetarskap och erbjuder trygga, förmånliga arbetsvillkor? Välkommen att söka anställning som Postdoktor vid institutionen farmaceutisk biovetenskap på...
-
Doktorand i cancerprecisionsmedicin
4 weeks ago
Uppsala, Sweden Uppsala universitet Full timeArbetsuppgifter Projektet syftar till att hitta nya målgener för riktad cancerbehandling. Nya målgener för collateral lethality-strategier kommer att sökas genom analyser av konstitutionella varianter i populationsdatabaser. Gener uppreglerade i kärl, bindväv och immunceller i tumörer kommer att identifieras genom analys av...
-
Doktorand i kemokin-immunobiologi
4 weeks ago
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timePhD student in chemokine immunobiology - HORIZON-MSCA-2022-DN Doctoral Network “B-ACTIVE” These projects, funded by the Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)-doctoral network program "B-ACTIVE", is a EU-funded collaboration between the universities of Leuven, Copenhagen, Graz, Ljubljana, Uppsala and several industrial partners located in Copenhagen,...
-
Uppsala, Sweden Uppsala universitet Full timePostdoktor inom Excellenscentrat Livets Kemiska Mekanismer vid Uppsala universitet Institutionen för kemi – BMC bedriver forskning och utbildning inom analytisk kemi, biokemi och organisk kemi. Drygt 100 personer arbetar vid institutionen. Nya medarbetare och studenter rekryteras från hela världen och engelska är det huvudsakliga arbetsspråket....
-
Postdoktor inom polyploid genomik
4 weeks ago
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timePostdoktor inom Polyploidsgenomik Institutionen för ekologi och genetik utlyser en postdoktortjänst i Polyploidsgenomik, finansierat av VR, till programmet för Växtekologi och evolution. Institutionen för ekologi och genetik, Uppsala Universitet. Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med personal och studenter från hela...
-
Forskningsassistent
2 weeks ago
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timeVi söker en dynamisk och påhittig forskningsassistent som kommer att hjälpa till med administration och logistik för PERCEPT:s utlandsstudier som utforskar krigsrelaterad trauma, exponering för upprepad mediabevakning av krig och traumatiska upplevelser av kränkningar av internationell humanitär lag. Projektet syftar till att utveckla innovativa...
-
Uppsala, Sweden Uppsala universitet Full timeInstitutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som alla fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden...
-
Uppsala, Sweden Uppsala universitet Full timeInstitutionen för cell- och molekylärbiologiär indelad i sju forskningsprogram som alla fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden till...
-
Uppsala, Sweden Uppsala universitet Full timeInstitutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi. Den vetenskapliga grunden för det vi gör finns...
-
Uppsala, Sweden Uppsala kommun Full timeDiarienr: UBN Arbetsplats: Berga anpassad grundskolaFörvaltning: UtbildningsförvaltningenPublicerad: Sista ansökningsdag: Har du erfarenhet av arbete som skolsköterska med barn och unga och vill ta dig an en ny utmaning? Drivs du av att ha ett jobb som gör skillnad och där du får möjlighet att jobba med kompetenta kollegor? Då kan du vara den vi...
-
Universitetsadjunkt i miljörätt
7 days ago
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timeJuridiska fakulteten i Uppsala är Nordens äldsta juridiska fakultet och fanns redan när universitetet grundades år 1477. Här finns en utbyggd och väl ansedd grundutbildning och forskarutbildning. Vid fakulteten finns Juridiska institutionen, där omkring 200 personer har sin anställning. Arbetsuppgifter I anställningen ingår undervisning...
-
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timeJuridiska fakulteten i Uppsala är Nordens äldsta juridiska fakultet och fanns redan när universitetet grundades år 1477. Här finns en utbyggd och väl ansedd grundutbildning och forskarutbildning. Vid fakulteten finns Juridiska institutionen, där omkring 200 personer har sin anställning. Arbetsuppgifter Undervisning i associationsrätt på...
-
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timeJuridiska fakulteten i Uppsala är Nordens äldsta juridiska fakultet och fanns redan när universitetet grundades år 1477. Här finns en utbyggd och väl ansedd grundutbildning och forskarutbildning. Vid fakulteten finns Juridiska institutionen, där omkring 200 personer har sin anställning. Arbetsuppgifter Undervisning i associationsrätt på...
-
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timeJuridiska fakulteten i Uppsala är Nordens äldsta juridiska fakultet och fanns redan när universitetet grundades år 1477. Här finns en utbyggd och väl ansedd grundutbildning och forskarutbildning. Vid fakulteten finns Juridiska institutionen, där omkring 200 personer har sin anställning. Arbetsuppgifter Undervisning i redovisningsrätt och...
-
Doktorand i systematisk biologi
3 weeks ago
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timeLabbet fokuserar på att förstå utvecklingen av genom och den genetiska grunden för anpassning hos svampar. Vi upptäckte nyligen att många svampar har massiva transposerbara element, kallade Starships, som rörliggör en stor mångfald av svampgener. Vi har nu dechiffrerat hur Starships rör sig inom genomen, men en växande mängd bevis tyder på att...
-
Uppsala, Sweden Sveriges Lantbruksuniversitet Full timeInstitutionen för skoglig mykologi och växtpatologi En doktorandtjänst i beräkningsmikrobiell ekologi finns vid Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi, Sveriges lantbruksuniversitet i Uppsala. Doktorandanställningen är en del av en forskarskola inom SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap...
-
Postdoktor i molekylär ekologi
3 weeks ago
Uppsala, Sweden Uppsala universitet Full timeInstitutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med personal och studenter från hela världen. Vår forskning omfattar allt från evolutionär ekologi och genetik till studier av ekosystem. Se vidare . Vi söker nu en postdoktor i molekylär ekologi till programmet för Zooekologi. Projektbeskrivning Vi anställer en postdoktor...
-
Budbilschauffr - Uppsala
4 weeks ago
Uppsala, Sweden SIMPLEX Full timeJobbannons: Budbilschauffr i Uppsala Plats: Uppsala Anstllning: Heltid Arbetstider: Mndag till fredag 08:00 till 17:00 Krav: Bkrkort Lokalknnedom i Uppsala God serviceknsla Ansvarsfull och noggrann Vi erbjuder: Konkurrenskraftig ln Stabil anstllning Mjlighet till utveckling inom fretaget Ansk nu genom att skicka ditt CV och personligt brev....
-
Budbilschaufför - Uppsala
4 weeks ago
Uppsala, Sweden SIMPLEX Full timeJobbannons: Budbilschaufför i Uppsala Plats: Uppsala Anställning: Heltid Arbetstider: Måndag till fredag, 08:00 till 17:00 Krav: B-körkort Lokalkännedom i Uppsala God servicekänsla Ansvarsfull och noggrann Vi erbjuder: Konkurrenskraftig lön Stabil anställning Möjlighet till utveckling inom företaget Ansök nu genom att skicka ditt...
-
Uppsala, Sweden Uppsala Universitet Full timeWISE Postdoktor inom nanoteknologi och funktionella material med inriktning mot funktionella biopolymermaterial Avdelningen för nanoteknologi och funktionella material är en del av institutionen för materialvetenskap vid Ångströmlaboratoriet. Vi bedriver forskning inom funktionella porösa material för energi- och miljötillämpningar,...
