Staff Scientist in Computational Metabolomics

4 weeks ago

Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

Social network you want to login/join with:

Client:Location:Job Category:

Other

EU work permit required:

Yes

Job Reference:Job Views:

82

Posted:

23.01.2025

Expiry Date:

09.03.2025

Job Description:

Staff Scientist in Computational Metabolomics

We are now expanding our capacity to support life science researchers in metabolomics to transform complex data into meaningful biological and chemical interpretations. The successful applicant will be integrated in a national Computational Metabolomics Group jointly between the Metabolomics and NBIS Platforms. The work will offer excellent opportunities to further improve and develop skills to address application driven data science and bioinformatics challenges in metabolomics and also address multi-omics integration.

Duties

We are seeking an expert in using chemometrics, data science and/or bioinformatics tools and their applications in the analysis of metabolomics data as well as integrative omics. You will be responsible for supporting users of the Metabolomics platform in data analyses, advanced data-driven modelling, machine learning, multivariate analysis, and other statistical methods. This role will provide national support to the Swedish Metabolomics Centre (SMC), the Chalmers Mass Spectrometry Infrastructure (CMSI), the Exposomics Platform, and the Swedish NMR Centre. Through close collaboration with Swedish research groups, the expert will offer data analytical support across a wide range of studies under a "fee for service" model.

The complexity of data analytics will vary based on the research questions to be addressed. Examples of research questions include studying metabolic impact in different biological model systems to produce particular phenotypes, discovery of metabolite biomarkers related to disease, lifestyle or chemical exposures and investigating metabolic pathway regulation in relation to disease outcomes in large-scale cohort studies. Responsibilities include planning and executing analyses, communicating directly with users in academia and industry, writing and presenting results and reports and staying abreast of current developments in the field. In addition, the work involves providing advanced bioinformatics training to the Swedish metabolomics research community.

The role as Staff Scientist will involve regular internal and external meetings and learning opportunities, as well as time for professional development and the opportunity to learn from a diverse team of colleagues at NBIS and the SciLifeLab Metabolomics Platform. The work will include some amount of travel to other Swedish universities as knowledge exchange is an integral part of our operation. Professional development activities will focus on cultivating cutting-edge expertise for the analysis of current and emerging data types.

Qualifications

Required qualifications for the position:

  • PhD in Bioinformatics, Chemometrics, Metabolomics or related subjects the employer considers of relevance to the position.
  • Experience in advanced data analytics and modeling, including statistics and multivariate data analyses, of metabolomics data from high-throughput methods with applications in life science.
  • Strong understanding and experience working with mass spectrometry data, including the biological interpretation of data to understand complex chemical and biological systems.
  • Ability to independently perform data analysis and scientific deduction based on metabolomics data at an internationally competitive level.
  • Proficiency in a scripting language such as Python, R or Matlab.
  • Excellent communication skills in both written and spoken English and the ability to collaborate with scientists from diverse backgrounds.

Additional qualifications that are meriting for this position are:

  • Experience in advanced integration of multi-omics data, such as metabolomics, exposomics, proteomics, transcriptomics and microbiota.
  • Experience working with imaging data (e.g. mass spectrometry imaging, cryo-EM)
  • Expertise in design of experiments.

"Reproducible research" and "FAIR data" are central concepts to us, and expertise in the development of reproducible code by using code sharing platforms, workflow languages and container solutions is a strong merit. Strong emphasis will be placed on personal suitability for the position, such as the ability to drive projects and work in a collaborative, yet service-minded environment. A willingness to learn new methods and to rapidly acquire new skills is important for this position. Consideration will be given to how the applicant's experience and skills complement and strengthen the Computational Metabolomics Group and the scientific knowledge within NBIS and the Metabolomics platform in general.

Further information

The position is full time and permanent. Probationary employment 6 months may be applied. Starting date 2024-10-01 or according to agreement. Umeå University applies individual salary setting.

#J-18808-Ljbffr

  • Staff Researcher in Computational Metabolomics

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

    About the Team">As a Staff Researcher in Computational Metabolomics, you will be part of a dynamic team of researchers and scientists who are passionate about advancing the field of metabolomics.">Main Responsibilities">Data Analysis: Perform advanced data analytics and modeling on metabolomics data from high-throughput methods with applications in life...

  • Metabolomics Data Scientist

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

    About the Position">We are seeking an experienced Metabolomics Data Scientist to join our team at TN Sweden.">Main Duties">Support users of our Metabolomics platform in data analysis, advanced data-driven modeling, machine learning, multivariate analysis, and other statistical methods.Develop and implement new methods for data analysis and interpretation,...

  • Computational Biologist in Metabolomics

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

    About the Job">As a Computational Biologist in Metabolomics, you will play a key role in supporting the development of new methods for data analysis and interpretation in metabolomics.">Main Responsibilities">Data Analysis and Modeling: Perform advanced data analytics and modeling on metabolomics data from high-throughput methods with applications in life...

  • Staff Scientist

    4 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Staff Scientist (distribuerade molnsystem)Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultetUmeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden. Institutionen för...

  • Staff Scientist

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Vi erbjuder dig en chans att bli en del av vår internationella forskargrupp och att bidra till utvecklingen av nya teknologier inom rymdväderforskningen. Som staff scientist kommer du att arbeta nära kollegor från olika bakgrunder och nationer.Vårt team arbetar med avancerad datorteknik och simulationsteknik för att förstå komplexa fenomen inom...

  • Staff scientist

    1 week ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...

  • Staff scientist at Umeå Centre for Electron Microscopy

    3 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

    Social network you want to login/join with:Client:Location:Job Category:OtherEU work permit required:YesJob Reference:79ca13524957Job Views:3Posted:02.04.2025Expiry Date:17.05.2025Job Description:Umeå University is looking for a Staff Scientist with experience in cryo-electron microscopy (cryo-EM). The position is financed by grants from SciLifeLab for work...

  • Staff scientist

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...

  • Staff Scientist

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...

  • Research Scientist in Microbial Ecology

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

    About the Role:We are seeking a highly motivated and experienced Postdoctoral Researcher to join our team at TN Sweden as a Research Scientist in Microbial Ecology. The successful candidate will work closely with our research group to investigate the interactions between microbial species and their impact on human health.Key Responsibilities:To identify...

  • Staff scientist, 1 år

    3 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden. Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med...

  • Staff scientist

    1 week ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...

  • Staff scientist inom människa-AI interaktion, 12 mån

    1 week ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Staff scientist inom människa-AI interaktion, 12 månUmeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultetUmeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden.Den...

  • Staff scientist position at the Protein Expertise Platform

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

    Social network you want to login/join with:Staff Scientist Position at the Protein Expertise Platform (PEP), UmeåClient:Location:Job Category:OtherEU Work Permit Required:YesJob Reference:6f6ed5d67ca7Job Views:78Posted:23.01.2025Expiry Date:09.03.2025Job Description:PPS primarily serves academic research groups at Swedish universities but also collaborates...

  • Staf scientist för genetiska screeningar

    1 week ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Bli en del av forskargruppenVi letar efter en staff scientist som vill bli en del av vår forskargrupp. Som staff scientist kommer du att leda och genomföra arbetet som krävs för att besvara flera olika frågeställningar. Dina arbetsuppgifter kommer att innefatta att utföra en rad olika biomedicinska tekniker såsom genetisk framtagning av biosensorer,...

  • Staff Scientist vid CIRC

    1 day ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...

  • Staff scientist inom människa-AI interaktion, 12 mån

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...

  • Research Scientist in Computer Vision

    2 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden TN Sweden Full time

    The Department of Computing Science at TN Sweden is looking for a research engineer to join their team in Umeå.The purpose of the Wallenberg research arena for Media and Language is to build a world-class research community around Artificial Intelligence for Media and Language that cuts across scientific disciplines and industry segments.Main...

  • Staff scientist inom människa-AI interaktion, 12 mån

    3 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...

  • Staff scientist inom medicinsk kemi

    4 weeks ago

    Umeå, Västerbotten, Sweden Umeå Universitet Full time

    Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå...